Начало формированию музейной коллекции народного искусства Алтая положили первые экспедиционные изыскания Л.И. Снитко 1968-69 гг. Тогда из Усть-Коксинского района Горного Алтая были привезены старообрядческие орнаментированные полотенца, тканые пояса, элементы костюма. В настоящее время коллекция народного искусства Алтая насчитывает более 700 единиц хранения и включает произведения домовой, прялочной росписи и резьбы по дереву, старинной керамической посуды и бытовой утвари. Коллекция традиционного текстиля состоит из предметов народного ткачества: праздничных поясов, домотканых узорных полотен и скатертей, браных и вышитых орнаментированных полотенец. Народный костюм в собрании музея представлен комплексами одежды русских старожилов и переселенцев, мордовским женским костюмом, элементами чувашского и алтайского костюмов. Основным источником поступления являются экспедиционные приобретения и находки, частные собрания коллекционеров. В последние годы коллекция активно пополняется современными произведениями народных мастеров традиционных ремесел.