Коллекция графических произведений алтайских художников формируется с первых лет существования музея. Сегодня в собрании представлены произведения разных поколений алтайских графиков от 1950-х годов до наших дней. Главным жанром современной алтайской станковой графики, как и в живописи, является пейзаж. Его лирическое воплощение достигается при помощи разнообразных графических техник: акварели (А.А. Югаткин), линогравюры (А.Г. Вагин), офорта (Ю.Б. Кабанов, В.П. Туманов). Большое развитие в станковой и книжной графике получила тема жизни и творчества В.М. Шукшина, в русле которой яркие образы созданы А.К. Дерявским, В.А. Раменским, А.Н. Потаповым.